В мае 1748 г. поступил указ Военной Коллегии, по которому все казачьи части Оренбургской губернии сводились в Оренбургское нерегулярное войско. Велено также было «произвесть по старшинству и достоинству ко всему обретающемуся в Оренбургской губернии Нерегулярному корпусу в атаманы того же Нерегулярного корпуса сотника Василия Могутова и как Самарских, так и Уфимских находящихся в той Оренбургской губернии казаков и дворян для лутчего порядку и содержания быть и числить в одной команде и жалованье давать, а за повышение вычет на госпиталь и верности присягу учинить ему по указу при команде, а прежнего самарских казаков атамана Матвея Шилова за совершенною старостью от казачьей службы отставить и об отпуске его на свое пропитание учинить по указу».
Правительствующий Сенат и Военная Коллегия самым серьезным образом относились к формированию и организации нового казачьего войска. По указу императрицы Елизаветы Петровны от 22 июля 1748 г. Оренбургскому губернатору И.И.Неплюеву из Военной Коллегии пришел запрос о составлении штата «нерегулярным людям» и уже 10 декабря 1748 г. роспись штата была представлена. По этой росписи состав нерегулярных людей в Оренбургской губернии определялся в 4493 человека, из них местных — 2250 человек, переселенцев-«черкасов» — 849 человек и остальные — городовые и станичные казаки, переведенные с Белгородской, Симбирской, Царицынской, Корсунской и других линий. Более 3/4 их составляли русские, православные и около четверти — представители неславянских народов.
Следующий указ Военной Коллегии от 1 мая 1753 г. за №3214, подписанный Апраксиным, Петром Сумароковым, Василием Суворовым*, обер-секретарем Сергеем Поповым и Антоном Воропановым предписывал Оренбургскому губернатору И.И.Неплюеву «во всех находящихся в Оренбургской губернии нерегулярных войсках учинить общий штат с показанием сколько тех нерегулярных войск и с какими жалованными окладами или без жалованья по тамошней иногда возможности на собственном пропитании содержать надлежит». В ответном донесении И.И.Неплюев сообщал, что в Оренбурге и принадлежащих к нему крепостях, в Ставропольском (под Самарой) ведомстве и в двух провинциях — Уфимской и Исетской — до 1753 г. состояло 4050 человек нерегулярных людей, из них на жалованье — 1702 человека, получивших в общей сложности 11579 рублей 84 копейки. Остальные получали жалованье и провиант, как полагалось нагайбакам и Ставропольским крещеным калмыкам, в количестве 250 человек причисленным к Оренбургскому нерегулярному войску в 1748 г., то есть, только «при чрезвычайных и дальних командировках».
Оперативно, уже 17 мая 1753 г. последовал новый указ Военной Коллегии, содержащий подробное расписание всех штатов Оренбургского нерегулярного войска с указанием сумм, отпускаемых на их содержание. По данному указу войско должно было содержать в самом г.Оренбурге и прилегающей к нему Бердской слободе: — одного атамана, которого «именовать атаманом Оренбургского Казачьего Войска» с жалованьем 100 руб. в год; — одного есаула с жалованьем 50 руб. в год; семь сотников с жалованьем 30 руб. в год каждому; — одного старшего писаря с жалованьем 24 руб. в год; — семь хорунжих, 14 пятидесятников, 7 сотенных писарей и 700 рядовых с жалованьем по 15 руб. в год. Всего на сумму 10500 руб. в год.
Помимо жалованья, всем казакам разрешалось заниматься ремеслами и торговлей, но чтобы это не сказывалось на службе. Впрочем, для особо сметливых и удачливых казаков-мастеровых и казаков-торговцев допускались определенные льготы, а именно — возможность, при подходе очереди отправляться в наряд, нанимать вместо себя других казаков («наёмка», как ее называли яицкие казаки).
В крепостях и форпостах Оренбургского ведомства, расположенных по рекам Самара и Яик, предписывалось содержать 800 казаков, в том числе 15 атаманов и15 хорунжих с годовым жалованьем в 9 и 7 руб. соответственно; рядовым казакам полагалось по 3 руб. в год.
Казаков Ставропольского ведомства (Ставрополь, Самара и Алексеевка) полагалось содержать 250 человек, в том числе трех атаманов, трех хорунжих и одного писаря, все — без жалованья.
В г.Уфе полагалось иметь на жалованье 150 казаков, включая одного атамана, одного сотника и писаря. Из их числа комплектовался Оренбургский нерегулярный корпус. Все остальные уфимские казаки считались сверхштатными, кормились своим трудом и привлекались на службу на вакантные места.
В крепостях Уфимской провинции — Табынской, Красноуфимской, Ельдяцкой и Нагайбацкой — должно было иметь 1100 казаков, назначенных служить без жалованья, включая 4 есаулов, 4 сотников, 4 хорунжих и 4 писарей.
Точно так же, без жалованья, предписано было служить и казакам Исетской провинции, численность которых определялась в 1380 человек, включая 6 есаулов, 6 сотников, 6 хорунжих и 6 писарей.